Każdy z nas miał do czynienia z zanieczyszczeniem w laboratorium. Istnieją dwa główne rodzaje zanieczyszczeń - biologiczne (bakterie lub grzyby) i chemiczne - oba mogą łatwo zepsuć ci dzień, sprawiając, że hodowle komórkowe nie będą nadawały się do użytku, a wyniki eksperymentów zostaną przekłamane. Poniżej omówimy wiele sposobów, dzięki którym można uniknąć rozprzestrzeniania się zanieczyszczeń w laboratorium.
Sterylizuj swój sprzęt
Najpopularniejszym środkiem zapobiegającym skażeniu w laboratorium jest sterylizacja. Autoklawowanie, które polega na zastosowaniu intensywnego ciepła i ciśnienia, jest stosowane w większości laboratoriów do czyszczenia sprzętu i materiałów eksploatacyjnych. Podczas sterylizacji w autoklawie nie należy zapominać o stosowaniu pojemników, które są wyspecjalizowane do pracy w podwyższonym cieple i ciśnieniu w cyklach autoklawowych; polipropylen jest zazwyczaj odpowiednim materiałem na pojemniki do autoklawu, natomiast szkło Pyrex i metal mogą być również poddawane sterylizacji w autoklawie bez pęknięć lub wypaczeń. W przypadku wszystkich pojemników pamiętaj o naklejeniu etykiet, które nie zawiodą pod wpływem ekstremalnych temperatur i ciśnienia stosowanego cyklu oraz będą odpowiednie dla powierzchni pojemników (zastosowanie wydruku termotransferowego da również największą odporność na rozmazanie spowodowane wysoką temperaturą).
Sterylizacja powinna odbywać się często również na stanowisku. 70% roztwór etanolu, rozpylony na stanowisku lub wewnątrz szafy biobezpieczeństwa, usunie prawie wszystkie zanieczyszczenia bakteryjne i grzybicze, natomiast użycie rozcieńczonego stężenia wybielacza zdezynfekuje równie skutecznie. Czyszcząc materiały eksploatacyjne i sprzęt przed umieszczeniem ich w szafie bezpieczeństwa biologicznego, należy pamiętać o odczekaniu kilku minut na odgazowanie, ponieważ etanol może nadal utrzymywać się w powietrzu. W tym przypadku etykiety odporne na działanie substancji chemicznych zapewnią, że pozostaną one przytwierdzone po pokryciu ich środkiem sterylizującym, a użycie wydruku termotransferowego będzie odporne na rozmazanie, które powstaje w wyniku kontaktu z etanolem i wybielaczem.
Sprawdzaj jakość wody i powietrza
Konsekwentne sprawdzanie jakości powietrza i wody w laboratorium może uchronić Cię przed niepożądanymi kłopotami w późniejszym czasie, gdy zanieczyszczenia zaczną się wkradać do Twoich hodowli. Systemy takie jak XiltriX mogą śledzić ewentualne zanieczyszczenia w powietrzu w laboratorium i inkubatorach, alarmując natychmiast poprzez system oparty na chmurze, gdy tylko pojawi się coś niezwykłego. W przypadku łaźni i inkubatorów konieczne jest używanie autoklawowanej wody, którą warto wymieniać co najmniej raz w tygodniu. Można też zastosować kilka roztworów antybiotyków, np. SigmaClean®, które zapobiegną rozwojowi bakterii i grzybów. W przypadkach, gdy woda jest podejrzana o zanieczyszczenie, zwłaszcza mykoplazmą, istnieją zestawy oparte na fluorescencji lub reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR), które mogą wykryć zanieczyszczenie. Mykoplazma jest szczególnie trudna do wychwycenia, ponieważ trudno ją wykryć naocznie, nawet przy użyciu mikroskopu. Częste testowanie próbek wszystkich linii komórkowych, nawet jeśli nie wyglądają na zanieczyszczone, może zaoszczędzić wiele kłopotów, zwłaszcza gdy eksperymenty z wykorzystaniem komórek dają wyniki, które nie mają sensu w porównaniu ze starymi wynikami.
W przypadku laboratoriów IVF, lotne związki organiczne (VOC) są również uważane za zanieczyszczenia powietrza. LZO, jak aldehydy i alkohole, mogą pochodzić z różnych źródeł, w tym z niektórych rodzajów mebli, plastikowych naczyń, które nie zostały odgazowane, a nawet z perfum. Te lotne związki organiczne mogą mieć szczególnie negatywny wpływ na wskaźniki urodzeń, więc upewnienie się, że zostały wyeliminowane jest ważne dla każdego laboratorium IVF. Redukcja lotnych związków organicznych może również teoretycznie pomóc w standaryzacji eksperymentów z każdym rodzajem komórek, które są na nie tak wrażliwe jak ludzkie jaja, sperma i zarodki.
Rozważ antybiotyki
Nie wszyscy popierają stosowanie antybiotyków w hodowli komórek. Niektóre antybiotyki, jak penicylina/streptomycyna (PenStrep), wywołują zmiany w ekspresji i regulacji genów na poziomie genomu.1 Ze względu na oporność, nie gwarantują one również, że hodowle pozostaną wolne od zanieczyszczeń. Jednak wiele osób nadal polega na antybiotykach, aby zapewnić czystość swoich hodowli, uzyskując spójne wyniki, niezależnie od ich efektów ubocznych. Pamiętaj, że przy stosowaniu antybiotyków zawsze warto sprawdzić ich wpływ na wyniki eksperymentu, aby przekonać się, czy nie wpływają one przypadkiem na system, nad którym pracujesz.
Zorganizuj swoje laboratorium
Niezależnie od tego, jak wiele metod zastosujesz, aby uniknąć zanieczyszczenia, nic nie będzie działać konsekwentnie, jeśli nie zaplanujesz tego z wyprzedzeniem. Przygotowując się do eksperymentu, zawsze należy odłożyć na bok wszystko, co musi być wcześniej odkażone; dzięki temu nic nie będzie musiało być czyszczone w ostatniej chwili, co grozi zarówno skażeniem, jak i zepsuciem harmonogramu badania. Uporządkowanie zapasów butelek i innych roztworów zapobiega również gromadzeniu się kurzu, który może rozprzestrzeniać komórki bakterii i grzybów na próbki. Doskonałym sposobem na uporządkowanie i zaplanowanie wszystkiego jest zastosowanie systemu zarządzania informacją laboratoryjną (LIMS), który pomoże śledzić stan zapasów i zaplanować protokoły dekontaminacji. Aby w pełni wykorzystać możliwości systemu LIMS, kluczowe jest oznaczenie ważnych próbek i odczynników za pomocą kodów kreskowych lub etykiet RFID, co ułatwi zorientowanie się, co powinno, a co nie powinno znajdować się na stanowisku pracy, a także zarządzanie rzeczami potrzebnymi przed rozpoczęciem pracy w warunkach sterylnych. W przypadku PCR lub innych technik wrażliwych na zanieczyszczenia chemiczne, warto odłożyć na bok zestaw dedykowanych pipet, w czystym i bezpiecznym miejscu, dla tej konkretnej techniki.
Stosuj środki zdrowego rozsądku
Nie zapominaj o stosowaniu odpowiedniego sprzętu ochronnego, zwłaszcza gdy pracujesz w warunkach sterylnych. To nie tylko ochrona przed własnymi próbkami i chemikaliami; to także ochrona komórek i próbek przed Tobą! Noszenie rękawiczek, fartucha laboratoryjnego, okularów laboratoryjnych (jeśli są potrzebne) i opasek na włosy pozwoli uniknąć wpadania cząstek, takich jak keratyna i bakterie z Twojej skóry, do Twoich probówek, fiolek i płytek. Posprzątaj również po zakończeniu pracy! Ślady linii komórkowych pozostawione na ławce mogą zanieczyścić krzyżowo Twoje próbki, podobnie jak substancje chemiczne, takie jak formaldehyd, który kiedyś zniszczył wyniki ilościowego PCR w pewnym laboratorium, którego nazwy nie będziemy tutaj wymieniać. Niewiarygodnie obciążające - i potencjalnie niebezpieczne - jest również pozostawienie przez kogoś nieznanego proszku wokół skali pomiarowej, który może zanieczyścić powietrze w laboratorium.
Utrzymanie czystości w laboratorium może być trudne, zwłaszcza w dużych laboratoriach wykonujących wiele badań jednocześnie. Jeśli jednak uda się zorganizować przepływ pracy i zapasów, a także wdrożyć podstawowe zasady techniki sterylnej, istnieje duża szansa, że komórki i odczynniki będą wolne od zanieczyszczeń, co zmniejszy wysiłek, czas i pieniądze stracone z powodu zanieczyszczonych materiałów i nieudanych eksperymentów.
LabTAG firmy GA International jest wiodącym producentem wysokowydajnych etykiet specjalistycznych i dostawcą rozwiązań identyfikacyjnych stosowanych w laboratoriach.oraz dostawcą rozwiązań identyfikacyjnych stosowanych w laboratoriach badawczych i medycznych, a także w instytucjach opieki zdrowotnej.
